甲基化检测样本莂n硎约梁

DNA甲基化转化与离心柱式纯化试剂盒

?698.00

CWY122M

型号II,50测试/盒

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DNA经亚硫酸氢盐处置赏罚后,可使未甲基化的胞嘧啶转变为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶稳固,进而实现甲基化碱基的识别。本试剂盒将DNA变性和亚硫酸氢盐转化历程整合为一步,极大缩短了转化时间而不影响转化效率,转化效率可到达99.5%以上。

本试剂盒通过团结纯化柱,从亚硫酸氢盐修饰的溶液中接纳DNA,接纳的DNA纯度高,完整性好,可直接用于测序、甲基化PCR等下游实验。


? 转化速率快:转化反映仅需70 min。

? 转化接纳效率高:未甲基化的胞嘧啶转化效率≥ 99.5%,接纳率>80%。

? 投入量规模广:支持100 pg~2 μg规模DNA投入量。

? 样本兼容规模广:支持粪便、血液、组织、体液等提取纯化后的DNA、cfDNA为起shi样本。


1. 转化效率高

【实验1】以293细胞gDNA掺入1% Unmethylated Lambda DNA为模板,投入量划分为2 ng、10 ng、100 ng和500 ng,划分使用新利体育世纪CWY122以及行业标杆A公司的试剂盒举行亚硫酸氢盐处置赏罚糰n炕,获得的核酸使用λ DNA甲基化特异性引物举行扩zeng,扩zeng产物依ci举行AGE判断、胶接纳、NGS建库及剖析。

图1:甲基化转化试剂盒的转化效率秠uan刃Ч

实验效果批注:新利体育世纪的甲基化检测样本莂n硎约梁邪奏ぷ蜞奏さ男试99.5%以上。


2. 接纳率高

【实验2】以人甲基化DNA尺度品为模板,划分使用新利体育世纪CWY122和行业标杆A公司的试剂盒举行亚硫酸氢盐处置赏罚糰n炕,获得的核酸使用Nanodrop定量剖析。

图2:甲基化转化试剂盒的接纳率秠uan刃Ч

实验效果批注:新利体育世纪的甲基化检测样本莂n硎约梁械慕幽陕首芴逶80%以上,显着优于A公司。同时接纳率会因样本类型、样本DNA片断巨细、样本投入量以及样本质量而有所差异。

生涯条件 运输条件
吸附柱DF 2-8℃生涯,其余组分15-30℃生涯 吸附柱冰袋运输,其余组分室温运输
Q1:输入的DNA在转化之前是否应gai消融在?TE、水或其他缓冲液中?
A1:

水、TE 或改良的 TE 缓冲液可用于消融 DNA,而且不会滋扰转化历程。

Q2:甲基化转化时间可以延伸吗?
A2:

甲基化转化历程中,转化时间过久会引起甲基化的C部门酿成U,导致假阴性,请严酷an照操作说明书举行操作。

Q3:亚硫酸氢盐处置赏罚的DNA定量需要注重什么?
A3:

对基因组DNA举行亚硫酸氢盐处置赏罚后,由于非甲基化的胞嘧啶残基转化为尿嘧啶,以是原shi碱基配对不再存在,接纳的DNA通常富含A、UT,而且在室温下为单链,具有有限的非特异性碱基配对。260 nm处的吸收系数与RNA的吸收系数相似。当纯化后的基因组DNA OD2601时,相当于约40 μg/mL的核酸浓度。

Q4:处置赏罚后核酸检测OD值异常是为什么?
A4:

基于处置赏罚后核酸状态的特殊性,其OD230会泛起异常征象,可能导致OD260/OD230比值不稳固,实验批注这种情形不影响后续的PCR反映。OD260/OD280比值应为1.7-1.9。若是洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用ddH2O,比值会偏低,由于pH值和离子存在会影响光吸收值,但并不体现纯度低。

Q5:DNA接纳率较低可能的缘故原由息争决方案?
A5:

(1)对转化产物的定量方式选择错误:转化产物以单链形式存在,应使用ssDNA定量方式。

(2)Input DNA有杂质:确保DNA的A260/A280比值在1.8 - 2.0之间;

(3)漂洗缓冲液乙醇含量不足:请加入试剂瓶标签上指定体积的无水乙醇,勿长时间开盖放置; 

4)缓冲液DB中有机溶剂含量不足:请勿长时间开盖放置;

Q6:DNA转化率低可能的缘故原由息争决方案?
A6:

(1)转化液失效:转化液对光敏感,应避光生涯,阻止袒露在光线下;

(2)反映温度或时间设置错误:请an照说明书准确设置反映温度与时间;

3Input DNA样本GC投入量过高:应凭证样本特殊性适当镌汰投入量。

Q7:亚硫酸氢盐修饰后的DNA怎样储存?
A7:

亚硫酸氢盐修饰后的DNA建议连忙检测,否则请于-20℃以下生涯,生涯时间不凌驾1个月,恒久生涯需置于-70℃或以下,并应阻止重复冻融。

Q8:使用磁珠BQ需要注重什么?
A8:

使用磁珠BQ前,一定要混匀,磁珠BQ沉降速率较快,多个样本的加入磁珠的时间中心一定要经由几ci摇匀,推荐先加缓冲液CL及转化后产物,最后再加磁珠BQ,以免磁珠沉降。

Q9:转化液CR、缓冲液ND、缓冲液NP混淆后呈乳白色的污浊状态会影响后续实验吗?
A9:

正常征象,不影响试剂效果。

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